Fiche d'information pour Jones et al., une étude publiée dans PNAS , September 2018
Le don de sang bénévole, généreusement fourni par des bénévoles anonymes, nous a permis d'examiner les moyens de mieux traiter et éventuellement guérir le VIH. Ces résultats d'étude ont été publiés dans la revue PNAS en septembre 2018.
Le réservoir du VIH est principalement composé de lymphocytes T CD4+ infectés qui abritent une copie « dormante » du VIH en leur sein. Ces cellules infectées par le VIH de manière latente peuvent persister dans cet état dormant pendant des années, mais peuvent être activées à tout moment pour produire du VIH infectieux. Les traitements actuels du VIH bloquent efficacement la réplication virale mais ne ciblent pas le réservoir latent du VIH, et c'est pour cette raison que le traitement actuel du VIH doit être maintenu à vie. Nous rapportons ici une nouvelle méthode pour étudier la dynamique et la composition génétique des séquences latentes du VIH. Cette méthode utilise des informations concernant l'évolution du VIH chez chaque participant à l'étude, avant qu'il ne commence le traitement. L'article décrit le développement et la validation de cette méthode à l'aide de données de séquence du VIH simulées par ordinateur et précédemment publiées, puis décrit son application aux ensembles de données de séquence du VIH de deux participants qui ont accepté de participer à cette étude.
1) Quel était le but de notre étude ?
Le but de cette étude était de développer une méthode qui utilise les informations sur l'évolution du VIH chez un individu comme un outil pour mieux comprendre la dynamique du réservoir latent.
2) Comment cette étude est-elle liée à un remède contre le VIH ? ou au traitement des comorbidités du VIH ?
Un obstacle majeur à la guérison du VIH est que le virus s'intègre dans le génome humain, où il peut persister de manière latente pendant des décennies avant de produire un VIH infectieux. Il n'est pas clair si les séquences latentes du VIH s'accumulent continuellement dans le corps et si elles persistent indéfiniment. Si c'est le cas, le réservoir de VIH d'un individu devrait être constitué de séquences de VIH qui se sont intégrées à différents moments tout au long de leur parcours d'infection, même après de nombreuses années de traitement suppressif. Notre méthode a été conçue pour répondre à cette question et à d'autres questions fondamentales concernant la composition génétique du réservoir latent du VIH. Nous envisageons que les résultats de l'utilisation de notre méthodologie peuvent être utiles dans l'élaboration de stratégies de guérison du VIH.
3) Pourquoi les échantillons de participants sont-ils importants pour cette recherche ?
Sans les échantillons de participants, nous aurions été limités à la simulation informatique (qui peut ne pas refléter la réalité) et aux ensembles de données publiés (qui sont en nombre limité). n'aurait pas été possible sans la générosité des participants à l'étude.
4) Qu'est-ce qui a été appris ? Et ensuite ?
Nous avons appliqué notre méthodologie à deux participants qui avaient commencé un traitement plus de 5 ans après leur diagnostic de VIH et qui avaient ensuite maintenu une suppression virale sous traitement pendant environ une décennie. Chez les deux participants, nous avons constaté que les séquences du VIH dans leurs réservoirs latents avaient été semées tout au long de l'infection et avaient persisté jusqu'à nos jours. Chez un participant, nous avons isolé des souches virales latentes de plus de 20 ans. Nos prochaines étapes consistent à utiliser cette méthode pour comparer la composition du réservoir latent chez un plus grand nombre de participants ayant des antécédents cliniques différents. Nous espérons également comparer les séquences latentes du VIH dans différents types de cellules immunitaires et/ou emplacements dans le corps, ainsi que pour déterminer si le site spécifique d'intégration du VIH dans le génome humain influence la longévité d'une séquence latente donnée du VIH. Nous avons également l'intention d'étendre notre méthodologie pour utiliser des données de séquençage en profondeur.
Pour plus d'informations sur cette étude, veuillez contacter la Dre Zabrina Brumme (zbrumme@sfu.ca).
